BEDOPS v2.4.41
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6.3.1.1.
sort-bed
6.3.2.1.
starch
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Home
6. Reference
6.3. File management
6.3.2. Compression
ΒΆ
6.3.2.1.
starch
6.3.2.1.1. Inputs and outputs
6.3.2.1.1.1. Input
6.3.2.1.1.2. Output
6.3.2.1.2. Requirements
6.3.2.1.3. Usage
6.3.2.1.4. Options
6.3.2.1.4.1. Backend compression type
6.3.2.1.4.2. Note
6.3.2.1.4.3. Per-chromosome data integrity signature
6.3.2.1.4.4. Compression progress
6.3.2.1.4.5. Headers
6.3.2.1.4.6. Unique tag
6.3.2.1.5. Example
6.3.2.2.
unstarch
6.3.2.2.1. Inputs and outputs
6.3.2.2.1.1. Input
6.3.2.2.1.2. Output
6.3.2.2.2. Requirements
6.3.2.2.3. Usage
6.3.2.2.3.1. Extraction
6.3.2.2.3.2. Archive attributes
6.3.2.2.3.2.1. Metadata
6.3.2.2.3.2.2. Note
6.3.2.2.3.2.3. Timestamp
6.3.2.2.3.2.4. Compression type
6.3.2.2.3.2.5. Version
6.3.2.2.3.3. Whole-file or per-chromosome attributes
6.3.2.2.3.3.1. Data integrity
6.3.2.2.3.3.2. Elements
6.3.2.2.3.3.3. Bases
6.3.2.2.3.3.4. Duplicate element(s)
6.3.2.2.3.3.5. Nested element(s)
6.3.2.2.4. Example
6.3.2.3.
starchcat
6.3.2.3.1. Parallelization
6.3.2.3.2. Inputs and outputs
6.3.2.3.2.1. Input
6.3.2.3.2.2. Output
6.3.2.3.3. Usage
6.3.2.3.3.1. Per-chromosome data integrity signature
6.3.2.3.3.2. Example
6.3.2.4. Starch (v2.x) specification
6.3.2.4.1. Archive structure
6.3.2.4.2. Magic bytes
6.3.2.4.3. Chromosome streams
6.3.2.4.4. Metadata
6.3.2.4.4.1. Data
6.3.2.4.4.1.1. Archive
6.3.2.4.4.1.2. Streams
6.3.2.4.4.2. Offset
6.3.2.4.4.3. Hash
6.3.2.4.5. Padding
6.3.2.5.
starch-diff
6.3.2.5.1. Inputs and outputs
6.3.2.5.1.1. Input
6.3.2.5.1.2. Output
6.3.2.5.2. Requirements
6.3.2.5.3. Usage
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6.3.1.1.
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6.3.2.1.
starch
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6.3. File management